Znaczenie flag państwowych potwierdza praktyka i obserwowany zwyczaj międzynarodowy, tzw. „protokół flagowy”, w którym zawarta jest odległa, historyczna i podstawowa zasada pierwszeństwa znaków państwowych przed każdym innym znakiem. Inną zasadą protokołu jest pierwszeństwo znaków państwowych gospodarza, przed równorzędnymi im w hierarchii znakami państwa, w którego imieniu odbywa się wizyta przedstawicieli władz państwowych.

"Ponieważ nie istnieją przepisy unijne określające rolę flagi UE, a sama flaga unijna eksponowana jest przy różnych okolicznościach, nie ma potrzeby tworzenia takich przepisów, wytycznych, czy instrukcji, również w Polsce. Wystarczy przypomnienie podstawowych zwyczajów" - twierdzi MSWiA.

Ministerstwo podkreśla, że flaga Unii, będąc flagą organizacyjną, nie może być stosowana jako równorzędny znak z flagą państwową Rzeczypospolitej Polskiej. Flaga Unii może być więc eksponowana obok flagi polskiej wyłącznie na drugim miejscu, tj. na lewo od flagi polskiej.

Kolejną zasadą jest eksponowanie obu flag na masztach tej samej wysokości lub na drzewcach o tej samej długości oraz sporządzanie obu flag w tych samych wymiarach, o ile mają te same proporcje. Flagi mogą być wywieszane od zmierzchu do zmroku, przy dłuższej ekspozycji powinny być oświetlone.

Należy pamiętać, że flagi powinny być zawsze czyste, o czytelnych barwach i wzorze, nie pomięte i nie postrzępione. Nie należy wywieszać flag w dni deszczowe i przy silnym wietrze. Flaga nie powinna dotykać podstawy masztu.

MSWiA podkreśla, że flaga UE powinna być używana na budynkach, w których znajdują się agendy urzędów unijnych, i to eksponowana zarówno na zewnątrz, jak i wewnątrz. Jednak o ile na dachu takiego budynku będzie to tylko flaga unijna, to już przed i wewnątrz budynku, flaga Unii powinna towarzyszyć eksponowanej na pierwszym miejscu polskiej fladze państwowej. Nie powinno się, poza opisanym przypadkiem, flagi unijnej eksponować stale. Można ją natomiast wywieszać okazjonalnie.

Nie ma potrzeby eksponowania flagi UE w polskich urzędach (z wyjątkiem urzędu ds. integracji), szkołach, czy uczelniach, ale na pewno powinna być wywieszona obok polskiej flagi państwowej na wszystkich przejściach granicznych na granicy będącej granicą zewnętrzną Unii oraz na międzynarodowych lotniskach cywilnych i w portach morskich.

"Eksponowanie flagi unijnej w polskich placówkach dyplomatycznych w państwach znajdujących się na terenie Unii wydaje się zbyteczną ostentacją, natomiast można ją wywieszać w pozostałych państwach, o ile reprezentanci innych państw członkowskich tak postępują" - kończy MSWiA opis zasad eksponowania flagi Unii Europejskiej.